O Sistema de Seleção Unificada (Sisu) é um sistema eletrônico gerido pelo MEC que oferece vagas para instituições públicas de ensino superior de todo o Brasil, sendo a grande maioria delas ofertada por instituições federais (universidades e institutos). O sistema executa a seleção dos estudantes com base na nota do Exame Nacional do Ensino Médio (Enem). O SISU é realizado em duas edições anuais.
Desde 2013, a UFF utiliza o SISU como principal forma de seleção para ingresso em seus cursos de graduação, sendo a exceção o curso de Arquitetura e Urbanismo, que possui processo seletivo próprio.
Os candidatos inscritos no SISU para a UFF, são selecionados por ordem de classificação por campus, curso, formação, turno e modalidade de concorrência.

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